방역관리과
- 가축전염병 감시·검색
- 가축전염병 검진 및 기생충 구제
- 가축질병예찰협의회 운영
- 가축질병 혈청검사 및 병성감정
- 해외 악성 가축전염병 차단 방역
- 동물보호·복지
- 착유가축 위생검사
- 축산농가 지도·지원
- 기타 가축전염병예방법 관련 사항
축산위생과
- 도축검사
- 작업장 위생관리 지도
- 부정축산물 위생지도 및 검사
- 식육 중 유해 잔류물질 정성검사
- 식육 미생물 검사
- 축산항생제 내성균 검사
- HACCP 미생물 검사 및 지도
- 유방염 방제사업
- 그 밖의 <축산물위생관리법> 관련 사항
강화방역지원과
- 가축전염병 검진·검색
- 가축질병 방역지도 및 관리
- 가축질병 혈청검사 및 병성감정
- 종돈(계)장 위생관리 및 방역지도
- 착유가축 위생검사
- 질병예찰 및 소독방제지원
- 대민지원사업 및 양축농가 교육
정밀검사과
- 축산물가공품검사
- 한우확인검사
- 유통 식육 중 미생물검사
- 축산물 잔류물질 정량검사
- 식용란의 미생물 및 잔류물질 검사
- 조사료검사
야생동물구조관리센터
- 부상 또는 조난 야생동물 구조
- 야생동물 치료(수술) 및 관리
- 야생동물 재활 및 자연복귀
- 야생동물 생태 교육 프로그램 운영
- 야생동물 유래 질병검사 및 연구
- 생물다양성 보존을 위한 야생동물 유전자원 확보
