황기는 황형(黃衡)의 장남이다. 강화 월곶 태생으로 명문 출신이다. 중종 19년(1524) 별시 문과에 급제하였으며, 여러 관직을 거쳐 홍문관직제학, 동부승지를 역임하였다. 중종 32년(1537) 권신 김안로(金安老)의 천거로 대사간(大司諫)에 올랐으나 그의 청탁을 거부함으로써 길주 목사로 좌천되었다가, 그해 김안로 일당이 처형되자 우부승지로 발탁되었다. 이후로 승승장구 승진하여 경기도관찰사로 나가 치적을 쌓았으나 갑자기 사거하였다.